De NVAMM kent de volgende organisatie:

Een bestuur bestaande uit 5 AIOS medische microbiologie met de volgende functies:

  • Voorzitter en commissaris NVMM
  • secretaris
  • penningmeester
  • commissaris LVAG
  • Commissaris Concilium Microbiologicum Medicum

En drie commissies, te weten:

  • Opleidingscommissie
  • Wetenschapscommissie
  • Websitecommissie